MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 7129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020053	AATT	2	8	47	54	50 %	50 %	0 %	0 %	436736819
2	NC_020053	AAG	2	6	76	81	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
3	NC_020053	CACCGC	2	12	94	105	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	436736819
4	NC_020053	GAA	3	9	120	128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
5	NC_020053	TGCT	2	8	232	239	0 %	50 %	25 %	25 %	436736819
6	NC_020053	ATCGAT	2	12	246	257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436736819
7	NC_020053	AGA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
8	NC_020053	GAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736819
9	NC_020053	AATT	2	8	669	676	50 %	50 %	0 %	0 %	436736820
10	NC_020053	TCG	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
11	NC_020053	AGC	2	6	850	855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
12	NC_020053	TTA	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736820
13	NC_020053	CAA	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
14	NC_020053	ATT	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736820
15	NC_020053	CGC	2	6	1228	1233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
16	NC_020053	CTA	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736820
17	NC_020053	GCGA	2	8	1287	1294	25 %	0 %	50 %	25 %	436736820
18	NC_020053	CGA	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
19	NC_020053	CAAT	2	8	1420	1427	50 %	25 %	0 %	25 %	436736820
20	NC_020053	GGTG	2	8	1429	1436	0 %	25 %	75 %	0 %	436736820
21	NC_020053	CGAT	2	8	1524	1531	25 %	25 %	25 %	25 %	436736820
22	NC_020053	ATC	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736820
23	NC_020053	CAA	2	6	1639	1644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
24	NC_020053	CGA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
25	NC_020053	CAAC	2	8	1693	1700	50 %	0 %	0 %	50 %	436736820
26	NC_020053	GCC	2	6	1713	1718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
27	NC_020053	TCG	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
28	NC_020053	TTA	2	6	1861	1866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736820
29	NC_020053	AGC	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
30	NC_020053	TAA	2	6	1909	1914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736820
31	NC_020053	TCC	2	6	1923	1928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736820
32	NC_020053	GCGACC	2	12	1929	1940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	436736820
33	NC_020053	CTT	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736820
34	NC_020053	TGG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
35	NC_020053	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736820
36	NC_020053	A	6	6	2255	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	436736820
37	NC_020053	ACC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736820
38	NC_020053	CAAT	2	8	2353	2360	50 %	25 %	0 %	25 %	436736820
39	NC_020053	TC	3	6	2375	2380	0 %	50 %	0 %	50 %	436736820
40	NC_020053	TCC	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736820
41	NC_020053	AGA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736820
42	NC_020053	ACC	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736820
43	NC_020053	CAG	3	9	2574	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
44	NC_020053	TGT	2	6	2639	2644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736820
45	NC_020053	A	6	6	2659	2664	100 %	0 %	0 %	0 %	436736820
46	NC_020053	CGG	2	6	2673	2678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736820
47	NC_020053	AGC	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
48	NC_020053	A	6	6	2774	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	436736820
49	NC_020053	TGGG	2	8	2830	2837	0 %	25 %	75 %	0 %	436736820
50	NC_020053	TGG	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
51	NC_020053	ACA	2	6	2872	2877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
52	NC_020053	GTC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
53	NC_020053	CAAC	2	8	3062	3069	50 %	0 %	0 %	50 %	436736820
54	NC_020053	TAG	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
55	NC_020053	TGG	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
56	NC_020053	AAG	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736820
57	NC_020053	GAAA	2	8	3217	3224	75 %	0 %	25 %	0 %	436736820
58	NC_020053	TGT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736820
59	NC_020053	AAT	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736820
60	NC_020053	ATCAGC	2	12	3292	3303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436736820
61	NC_020053	CAA	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
62	NC_020053	GTA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
63	NC_020053	GGCAT	2	10	3499	3508	20 %	20 %	40 %	20 %	436736820
64	NC_020053	GGAATG	2	12	3518	3529	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	436736820
65	NC_020053	CCG	2	6	3578	3583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
66	NC_020053	GCC	2	6	3608	3613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736820
67	NC_020053	CTG	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736820
68	NC_020053	GGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736820
69	NC_020053	CAA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
70	NC_020053	TA	3	6	3917	3922	50 %	50 %	0 %	0 %	436736820
71	NC_020053	CGG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736820
72	NC_020053	GCA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
73	NC_020053	AGC	2	6	4161	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
74	NC_020053	CATCT	2	10	4171	4180	20 %	40 %	0 %	40 %	436736820
75	NC_020053	CAG	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
76	NC_020053	AGCT	2	8	4236	4243	25 %	25 %	25 %	25 %	436736820
77	NC_020053	ACG	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736820
78	NC_020053	GAT	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
79	NC_020053	CTA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736820
80	NC_020053	TGA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736820
81	NC_020053	TCGA	2	8	4569	4576	25 %	25 %	25 %	25 %	436736820
82	NC_020053	CAA	2	6	4578	4583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736820
83	NC_020053	TCCT	2	8	4638	4645	0 %	50 %	0 %	50 %	436736820
84	NC_020053	AATT	2	8	4657	4664	50 %	50 %	0 %	0 %	436736820
85	NC_020053	GGTC	2	8	4700	4707	0 %	25 %	50 %	25 %	436736820
86	NC_020053	ATA	2	6	4746	4751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736821
87	NC_020053	TA	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	436736821
88	NC_020053	AGT	2	6	4891	4896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736821
89	NC_020053	TGA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736821
90	NC_020053	TGA	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736821
91	NC_020053	ATC	2	6	5210	5215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736822
92	NC_020053	CGT	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736822
93	NC_020053	AGGT	2	8	5265	5272	25 %	25 %	50 %	0 %	436736822
94	NC_020053	AG	3	6	5289	5294	50 %	0 %	50 %	0 %	436736822
95	NC_020053	ATA	2	6	5401	5406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736822
96	NC_020053	ATA	2	6	5412	5417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736822
97	NC_020053	A	7	7	5417	5423	100 %	0 %	0 %	0 %	436736822
98	NC_020053	GGA	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736822
99	NC_020053	AAT	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736822
100	NC_020053	TTC	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736822
101	NC_020053	ATA	2	6	5609	5614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
102	NC_020053	CGT	2	6	5621	5626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736823
103	NC_020053	TAAA	2	8	5629	5636	75 %	25 %	0 %	0 %	436736823
104	NC_020053	ATT	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736823
105	NC_020053	AAT	2	6	5900	5905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
106	NC_020053	AAGCTA	2	12	5969	5980	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436736823
107	NC_020053	ACT	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
108	NC_020053	CTTT	2	8	6182	6189	0 %	75 %	0 %	25 %	436736823
109	NC_020053	GCA	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736823
110	NC_020053	ATCG	2	8	6277	6284	25 %	25 %	25 %	25 %	436736823
111	NC_020053	TCC	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736823
112	NC_020053	AGC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736823
113	NC_020053	CAATC	2	10	6328	6337	40 %	20 %	0 %	40 %	436736823
114	NC_020053	AATTA	2	10	6364	6373	60 %	40 %	0 %	0 %	436736823
115	NC_020053	ATAAC	2	10	6637	6646	60 %	20 %	0 %	20 %	436736823
116	NC_020053	CGTC	2	8	6721	6728	0 %	25 %	25 %	50 %	436736823
117	NC_020053	AG	3	6	6743	6748	50 %	0 %	50 %	0 %	436736823
118	NC_020053	GGA	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736823
119	NC_020053	CAT	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
120	NC_020053	TCG	2	6	6803	6808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736823
121	NC_020053	GAA	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736823
122	NC_020053	CCG	2	6	6869	6874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736823
123	NC_020053	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
124	NC_020053	TCGA	2	8	6931	6938	25 %	25 %	25 %	25 %	436736823
125	NC_020053	GAT	2	6	7021	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
126	NC_020053	CGC	2	6	7107	7112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736823
127	NC_020053	AG	3	6	7134	7139	50 %	0 %	50 %	0 %	436736823
128	NC_020053	GCC	2	6	7171	7176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736823
129	NC_020053	CGA	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736823
130	NC_020053	AG	3	6	7213	7218	50 %	0 %	50 %	0 %	436736823
131	NC_020053	CAT	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
132	NC_020053	AGCG	2	8	7473	7480	25 %	0 %	50 %	25 %	436736823
133	NC_020053	ATA	2	6	7591	7596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
134	NC_020053	AGT	2	6	7639	7644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
135	NC_020053	GTA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736823
136	NC_020053	ATA	2	6	7761	7766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736823
137	NC_020053	ACT	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736823
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140	NC_020053	GTT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736824
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142	NC_020053	ATCG	2	8	8241	8248	25 %	25 %	25 %	25 %	436736824
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144	NC_020053	CGA	2	6	8344	8349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736824
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148	NC_020053	CGAT	2	8	8572	8579	25 %	25 %	25 %	25 %	436736824
149	NC_020053	CAAGA	2	10	8645	8654	60 %	0 %	20 %	20 %	436736824
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154	NC_020053	CGC	2	6	9140	9145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736824
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163	NC_020053	GTG	2	6	9645	9650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736824
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165	NC_020053	TCG	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736824
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169	NC_020053	TCTTTA	2	12	9936	9947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	436736824
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173	NC_020053	TAAG	2	8	10127	10134	50 %	25 %	25 %	0 %	436736824
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246	NC_020053	TGTTGA	2	12	14763	14774	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436736831
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250	NC_020053	GAT	2	6	15158	15163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736832
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253	NC_020053	GGA	2	6	15253	15258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736832
254	NC_020053	GAGC	2	8	15261	15268	25 %	0 %	50 %	25 %	436736832
255	NC_020053	TCGC	2	8	15305	15312	0 %	25 %	25 %	50 %	436736832
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258	NC_020053	ATAA	2	8	15525	15532	75 %	25 %	0 %	0 %	436736832
259	NC_020053	TCA	2	6	15639	15644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736833
260	NC_020053	ATCTAA	2	12	15680	15691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	436736833
261	NC_020053	GCT	2	6	15726	15731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736833
262	NC_020053	ACT	2	6	15744	15749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736833
263	NC_020053	GTGA	2	8	15830	15837	25 %	25 %	50 %	0 %	436736833
264	NC_020053	ACA	2	6	15896	15901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736833
265	NC_020053	CTT	3	9	15931	15939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736833
266	NC_020053	GAA	2	6	15947	15952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736833
267	NC_020053	ATT	2	6	15998	16003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736833
268	NC_020053	TATC	2	8	16015	16022	25 %	50 %	0 %	25 %	436736833
269	NC_020053	CTT	2	6	16133	16138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736834
270	NC_020053	GCTTTT	2	12	16150	16161	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	436736834
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272	NC_020053	CTA	2	6	16193	16198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736834
273	NC_020053	GTT	2	6	16260	16265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736835
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279	NC_020053	AATT	2	8	16623	16630	50 %	50 %	0 %	0 %	436736836
280	NC_020053	GTG	2	6	16637	16642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736836
281	NC_020053	CAT	2	6	16644	16649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736836
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283	NC_020053	CTT	2	6	16839	16844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736836
284	NC_020053	CAACCA	2	12	16875	16886	50 %	0 %	0 %	50 %	436736836
285	NC_020053	TCA	2	6	16925	16930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736836
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289	NC_020053	T	6	6	17383	17388	0 %	100 %	0 %	0 %	436736837
290	NC_020053	CAC	2	6	17550	17555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736838
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293	NC_020053	TTG	2	6	17619	17624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736838
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381	NC_020053	CATC	2	8	23412	23419	25 %	25 %	0 %	50 %	436736848
382	NC_020053	CG	3	6	23481	23486	0 %	0 %	50 %	50 %	436736848
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385	NC_020053	GCTT	2	8	23914	23921	0 %	50 %	25 %	25 %	436736848
386	NC_020053	GAA	2	6	23944	23949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736848
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